屏東縣小琉球自發展觀光以來，大量的觀光人數帶來商機也帶來環境的問題。雖然在垃圾減量方面有很顯著的成效，但垃圾的清運量卻不減反增，最主要的原因是廚餘沒有被有效回收運用。島上所產生的廚餘，不到兩成的量是以採用堆肥的方式，做成培養土;其餘的廚餘則是被當成一般垃圾直接丟棄，影響的不只是清運成本，更擔心的是燃燒廚餘會降低焚化爐的運轉效能。 黑水虻有著大量進食、與不帶菌的生物特性，使之一躍成為農畜廢棄物及廚餘處理的新星物種。小琉球所遇到的狀況是每個離島都有的問題，若是可以運行成功，將可以為其他離島做為示範